生物医药产业是北京重点发展的战略性新兴产业之一，建立北京生物医药产业创新发展指数体系，对于分析和评价产业创新发展情况具有参考价值。本文以企业为主体，从创新环境、创新投入、创新产业、创新绩效4 个维度，选取8 个二级指标、20 个三级指标，分析评价了2009 ～ 2012 年北京生物医药产业创新发展情况。结果表明2009 年以来北京生物医药产业创新能力稳步提升，在创新环境、创新投入、创新产出、创新绩效4 个领域均取得了积极进展。